Научно-исследовательская и опытно-конструкторская деятельность университета осуществляется по следующим ключевым направлениям: нанотехнологии и новые материалы; биомедицинские и фармацевтические технологии; биотехнологии пищевых производств и переработки сельскохозяйственной продукции; аэрокосмические и геоинформационные технологии; территориальное планирование; нейрокомпьютеры, параллельные и высокопроизводительные вычисления; комплексная безопасность инфраструктурных объектов и территорий; гостиничный и туристический сервис; конфликтология; кавказоведение, культура и традиции народов Северного Кавказа; этнодемографические процессы.
Сформированная научная инфраструктура позволяет университету выполнять крупные исследовательские и технологических проекты, реализуемые в рамках Постановления Правительства Российской Федерации №218, №220, поддержанные Государственным заданием, научными фондами, а также выполнять работы по заказу коммерческих предприятий и органов власти.
Результаты исследований ученых СКФУ публикуются в ведущих мировых журналах, входящих в международные базы Web of Science и Scopus, а также представлены на ключевых форумно-выставочных мероприятиях, среди которых: Национальная выставка «ВУЗПРОМЭКСПО»; Всероссийский Фестиваль науки «Nauka 0+»; Международная выставка «PROЯблоко 2022»; Китайская выставка высоких технологий и др.
Дополнительную информацию о формах совместных научно-исследовательских работ с СКФУ можно получить в Департаменте науки.