СКФУ реализует следующие программы с возможностью получения двух дипломов:
Евразийский национальный университет им. Л.Н. Гумилева (Казахстан):
- Магистерская программа «Математическое и программное обеспечение защиты информации» (с 2020 г.);
Будапештский университет им. М. Корвина:
- Магистерская программа «Восточно-Центральная Европа» (с 2021г.);
- Магистерская программа «Кавказ в системе международных отношений» (с 2021г.);