Музейный центр СКФУ был создан в 2013 году с целью проведения музейной и экспозиционной работы и координации деятельности всех музеев в университете. С 2013 по 2017 гг. экспозиция ограничивалась одним залом, находящимся в холле 4 этажа корпуса 1. В 2017 г. к нему присоединился еще один зал с размещенной в нем экспозицией истории и современных достижений научных школ и направлений университета.

1 сентября 2023 г. в учебном корпусе 20 для посетителей распахнул двери новый Музейный комплекс. Это инновационный научно-образовательный центр, сочетающий интерактивные и традиционные средства представления музейного материала. 15 сенсорных столов, 16 проекционных поверхностей, 1 киннект-стол составляют интерактивную его часть и 15 витрин с музейными предметами, демонстрирующими награды, публикации, образцы разработок научных школ и структурных подразделений – традиционную музейную часть.

В экспозиции представлена история вошедших в состав СКФУ вузов – Ставропольского государственного университета, Северо-Кавказского государственного технического университета и Пятигорского государственного гуманитарно-технологического университета, охватывающая период с 1930 г. до 2012 г. – момента основания СКФУ, и современные достижения университета в научной, образовательной, культурно-воспитательной сферах. В отдельном сенсорном столе показана история университета и его достижения в разных сферах с 2012 г. и до настоящего времени.

Через историю высшего образования в регионе, через имена ученых, стоявших у истоков развития научных школ, признанных в России и мире, показана социальная и культурная история нашего края и округа в целом. Выдающимся ученым, преподавателям, выпускникам посвящены отдельные странички в сенсорных столах, ведь именно они являются нашей гордостью, трансляторами достижений университета по всей стране.